Bioinformatyka

Prowadzący: Joanna Szyda, Magda Mielczarek

UWAGA: II termin egzaminu (studenci o nr indeksów: 116544, 107267, 102404, 116551, 116557) proszę zgłosić się 11.02. o 10:45 do mojego gabinetu w Katedrze Genetyki

Wykłady:

• Wykład 1
• Wykład 2
• Wykład 3
• Wykład 4
• Wykład 5
• Wykład 6
• Wykład 7
• Wykład 8
• Wykład 9 – kontynuacja wykładu 8
• Wykład 10
• Wykład 11

Ważne daty:

• 07.01.2019 – Podanie listy grup i prezentowanych tematów
• 11.01.2019 – Kolokwium
• 18.01.2019 – Prezentacje

Ćwiczenia:

• Bioinformatyka_Lista_1
• Bioinformatyka_Lista_2
• Bioinformatyka_Lista_3 Zad 3. Download –> D. data via FTP
• Bioinformatyka_Lista_4
• Bioinformatyka_Lista_5 <— Bioinformatyka_Konspekt_1
• Bioinformatyka_Lista_6 (.txt –> .fastq)
• Bioinformatyka_Lista_7
• Bioinformatyka_Lista_8
• Bioinformatyka_Lista_9
• Bioinformatyka_Prezentacje_wytyczne
• Oceny

Czasopisma naukowe do prezentacji:

• Briefings in Bioinformatics
• BMC Bioinformatics
• Bioinformatics (bezpłatnie starsze niż 12 miesięcy)
• Current Bioinformatics
• PLoS Computational Biology

Pliki do ćwiczeń:

• SeqA  SeqB (proszę zmienić rozszerzenie .txt nad .fastq)
• Fellis_catus Homo_sapiens
• GO_input
• liczba_duplikacji
• out.raw (proszę zmienić rozszerzenie .txt nad .vcf)
• snps_in_vep