Bioinformatyka

Prowadząca wykłady i ćwiczenia: dr Magda Mielczarek

Wykłady:

  1. Wykład1
  2. Wykład2
  3. Wykład3
  4. Wykład4
  5. Wykład5
  6. Wykład6
  7. Wykład7
  8. Wykład8

Ćwiczenia: 

  1. Zajęcia organizacyjne
  2. Bioinf2324_Lista_1
  3. Bioinf2324_lista_2
  4. Bioinf2324_Lista_3  (Proszę przygotować się na zajęcia z interpretacji wykresów fastqc oraz składni trimmomatic, polecenia w powłoce bash będziemy wykonywać razem w sali komputerowej)
  5. Bioinf2324_Lista_4  (Proszę zapoznać się ze składnią poleceń dla każdego z programów i przypomnieć sobie formaty SAM, VCF. Polecenia w powłoce bash będziemy wykonywać razem w sali komputerowej). Brakujący plik vcf –> study.vcf.gz (proszę zlikwidować “podłogę” w nazwie)
  6. Bioinf2324_Lista_5
  7. 17.01.23 kolokwium
  8. 24.01.23 prezentacje (1)
  9. 31.01.23 prezentacje (2)

Materiały dodatkowe:

Naukowe:

Popularnonaukowe:

/usr/share/java/trimmomatic-0.35.jar