Narzędzia bioinformatyczne w naukach biologicznych

Prowadzący wykłady i ćwiczenia: Magda Mielczarek

Wykłady:

1. 1. NBNB_WD1
   2. NBNB_WD2
   3. NBNB_WD3
   4. NBNB_WD4 – Wprowadzenie do Galaxy (General Text Tools; Genomic File Manipulation; Genomics Analysis; Statistics and Visualization)
   5. NBNB_WD5
   6. NBNB_WD6
   7. NBNB_WD7

Materiały dodatkowe:

• Bash Scripting for Beginners: Hello World
• Bash Scripting for Beginners: Variables
• R dla początkujących
• Getting oriented in Rstudio

Ćwiczenia:

1. NBNB_lista_zad1
2. NBNB_lista_zad2
3. NBNB_lista_zad3 (zachowujemy wyniki DGE na później)
4. Linia poleceń – testowanie poleceń z wykładu 5.
5. NBNB_lista_zad4, bos
6. NBNB_lista_zad5, Dane_D.melanogaster (polecenie wget)
7. NBNB_lista_zad6, genome_ref
8. NGS_output

Dodatkowe materiały:

• Podstawy Bioinformatyki
  • PB_BD1
  • PB_BD2