Analiza danych pochodzących z sekwencjonowania następnej generacji

Prowadzący wykłady: Magda Mielczarek

Prowadzący ćwiczenia: Arkadiusz Dziech

Wykłady:

1. 07.03.25 NGS_WD1_25; PROJEKT_25
2. 14.03.25 NGS_WD2_25
3. 21.03.25 NGS_WD3_25
4. 28.03.25 NGS_WD4_25
5. 04.04.25 NGS_WD5_25
6. 11.04.25 NGS_WD6_25_v2
7. 25.04.25 NGS_WD7_25; Różne oblicza biologii
8. 09.05.25 NGS_WD8 / Best practices for variant calling in clinical sequencing
9. 16.05.25 NGS_WD9
10. 23.05.25 NGS_WD10 (godziny rektorskie (10:00 – 14:00))
11. 30.05.25 NGS_projekty
12. 04.06.25 NGS_projekty  (13:30-15:30, sala 301 na Antropologii)
13. 06.06.25 NGS_projekty
14. 13.06.25 NGS_projekty
15. Podsumowanie i dyskusja

–> ZAPISY! (maksymalnie 5 prezentujących grup na 1 wykład)

Ćwiczenia:

• bash_przypomnienie
• bos 
• R_norvegicus000020085003
• R_norvegicus20029952202
• R_norvegicus20033325665
• R_norvegicus20033325665.vcf
• R_norvegicus20029952202.vcf
• R_norvegicus000020085003.vcf

Tutoriale/Książki/Przydatne linki:

• Linux Command Line (mini ściągawka)
• Linux Command Line in The Open Bioinformatics Journal (artykuł)